消化道实际上是各种真菌侵入体内的重要途径，如果患者的肠部受到念珠菌、放线菌、毛霉菌、曲菌和隐珠菌等真菌影响的话，就会感染真菌性肠炎，给患者的健康带来很大的伤害，所以患者就应该尽可能地预防真菌感染。
想要预防真菌性肠炎的话，患者就可以采取以下几种措施：
一、避免诱因
1.控制广谱抗生素的应用，避免通用，减少长期应用，确因病情需要难免长期应用者应间隔一定阶段加用抗真菌药物，以防肠道菌群失调导致条件致病性真菌过度生长。
2.加强营养，提高机体抵抗力。
3.慎用糖皮质激素和免疫抑制药。
4.保护免疫功能低下患者口腔和肠道黏膜生理屏障的完整，减少创伤。
二、防止真菌污染，治疗原发病灶
1.恶性肿瘤和血液病病房应保持通风良好和干燥，防止真菌滋生，增加外源性感染的机会。
2.如果患者感染了艾滋病和其他免疫功能抑制病的话，就需要及时发现和治疗鹅口疮及其他部位的真菌感染，以免继发真菌性肠炎。
3.如果患者需要行静脉营养、血管导管检查和手术的话，就必须严格执行无菌操作，防止真菌性医院内感染。
三、药物预防
艾滋病患者、肠道手术和器官移植术患者等高危人群，如果想要预防真菌性肠炎就应该短期足量或长期小剂量预防用药。
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